秋季畜禽腹泻的内因是酶在畜禽胃肠道的发育成熟期活性较差，但营养需要相对较高，肠道负担重，造成胃肠调节机能较差，免疫功能也相对不够成熟。外因主要是由于秋季气温忽冷忽热，致病微生物大量增殖，畜禽更易患肠道疾病。

往年秋季，一些地区曾发生肉鸡坏死性肠炎的广泛流行。其特点是，大群中有10%～20%的鸡只发病，严重的鸡只消化不良、生长停滞、饲料报酬下降。并且本病经常与小肠球虫病并发或继发，而一般的药物和常规剂量难以产生疗效。给广大养鸡户 (场)造成了较大的经济损失。

由于本病常与小肠球虫病并发，且极易被后者所掩盖。最终的确诊常依赖于实验室诊断。该病确诊后的一般治疗原则是以治疗坏死性肠炎为主，兼治小肠球虫病为辅。进而依据药敏试验的结果，投喂高敏药物，可取得满意的临床治疗效果。

其实，在肉鸡、种鸡、蛋鸡、猪、鸭、鹅、牛等的养殖过程中，因为秋季季节原因所导致的以大肠杆菌、沙门氏菌感染为主的肠炎非常普遍。

我们应做好秋季预防肠炎的方案，那就是在饲料中长期添加耐药株培养过的乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌等微生态制剂。

因为畜禽肠道菌群是在长期进化过程中形成的，并与畜禽保持相对平衡稳定状态，对畜禽生长发育和抵抗疾病具有重要意义，一旦平衡失调，便会出现生产性能下降或发生疾病。正常情况下，动物肠道内优势种群为厌氧菌，占99%以上，其中主要包括拟杆菌、双歧杆菌、乳酸杆菌、消化杆菌、优杆菌等；而需氧菌及兼性厌氧菌只占1%。如该优势种群发生变化，上述专性厌氧菌会显着减少，而需氧菌和兼性厌氧菌增加，此时使用微生态制剂，可以平衡厌氧菌和需氧菌比例，迅速补充有益菌群，恢复畜禽肠道健康。